Появлению факультета биологии и экологии предшествовал химико-биологический факультет, который действовал в Гродненском государственном педагогическом институте имени Янки Купалы с 1963 по 1975 годы. На нем проводилась подготовка учителей биологии с дополнительной специальностью «Химия». В 1975 году, к сожалению, он был закрыт. Но спустя 10 лет, в 1984 году, когда вновь возникла потребность в биологических педагогических и научных кадрах, в Гродненском государственном университете имени Янки Купалы был открыт биологический факультет, осуществляющий подготовку студентов по специальности «Биология» с присвоением квалификаций: «Биолог. Преподаватель биологии и химии»; «Биолог. Преподаватель биологии и географии»; «Биолог. Преподаватель биологии. Практический психолог в учреждениях образования». После открытия специальности «Экология» в 1995 году факультет был переименован в факультет биологии и экологии.

В настоящее время факультет является крупным учебно-научным центром, в структуре которого 5 кафедр, научный гербарий, учебно-методический кабинет с современным компьютерным обеспечением, научно-исследовательская лаборатория Функциональной геномики, учебно-научно-производственная лаборатория технологии общественного питания, ряд учебных лабораторий.

На факультете работают более пятидесяти опытных и высокопрофессиональных преподавателей, среди которых 6 докторов наук, 25 кандидатов наук. Открыта аспирантура по пяти специальностям: «Биохимия», «Микробиология», «Физиология человека и животных», «Биотехнология», «Биофизика»; магистратура по трем специальностям «Биология», «Экология», «Биохимия». Имеется научная школа по биохимии.